磷酸化特異性抗體驗(yàn)證數(shù)據(jù)說(shuō)明
一、驗(yàn)證目的
驗(yàn)證該磷酸化特異性抗體對(duì)靶蛋白磷酸化修飾位點(diǎn)的識(shí)別特異性,評(píng)估抗體與同蛋白非磷酸化形式、同源蛋白及無(wú)關(guān)磷酸化蛋白的非特異結(jié)合情況,保障WB、ICC/IF、IP、IHC等實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確可靠,降低非特異信號(hào)帶來(lái)的實(shí)驗(yàn)干擾。
二、常規(guī)驗(yàn)證項(xiàng)目及數(shù)據(jù)說(shuō)明
1. Western Blot(WB)核心驗(yàn)證
(1)磷酸酶處理對(duì)照試驗(yàn)
試驗(yàn)分組:將同一批次細(xì)胞裂解液分為兩組,第一組不做磷酸酶處理,第二組加入堿性磷酸酶(CIP/λ-PPase)恒溫孵育,去除蛋白磷酸基團(tuán)。
合格數(shù)據(jù)表現(xiàn):未處理組可檢測(cè)到與目的分子量匹配的特異性條帶;磷酸酶處理組對(duì)應(yīng)的目的條帶信號(hào)顯著減弱;總蛋白抗體檢測(cè)各組條帶亮度無(wú)明顯差異,證明各組蛋白上樣量一致,條帶信號(hào)變化由蛋白去磷酸化修飾導(dǎo)致,而非蛋白樣本降解。
數(shù)據(jù)結(jié)論:磷酸酶處理可去除磷酸化抗原表位,降低抗體結(jié)合信號(hào),說(shuō)明抗體結(jié)合能力依賴(lài)靶蛋白的磷酸化修飾狀態(tài)。
(2)位點(diǎn)突變樣本驗(yàn)證
試驗(yàn)分組:野生型WT細(xì)胞(保留靶蛋白天然磷酸化位點(diǎn))、定點(diǎn)突變細(xì)胞(將目標(biāo)磷酸化氨基酸位點(diǎn)突變,抑制該位點(diǎn)磷酸化修飾)。
合格數(shù)據(jù)表現(xiàn):野生型樣本可檢出特異性磷酸化條帶,位點(diǎn)突變樣本磷酸化條帶信號(hào)明顯降低;總靶蛋白抗體檢測(cè)兩組樣本,條帶表達(dá)水平基本一致,排除蛋白表達(dá)量差異的干擾。
(3)藥物調(diào)控對(duì)照驗(yàn)證
采用特異性激酶激活劑、激酶抑制劑分別處理細(xì)胞,調(diào)控細(xì)胞內(nèi)靶蛋白的磷酸化水平。
合格數(shù)據(jù)表現(xiàn):激酶激活處理組磷酸化條帶灰度值高于空白對(duì)照組;激酶抑制處理組磷酸化條帶灰度值低于空白對(duì)照組;各組總蛋白條帶信號(hào)無(wú)明顯波動(dòng),證明藥物僅調(diào)控磷酸化修飾,不影響靶蛋白總體表達(dá)量。
2. 多肽封閉阻斷試驗(yàn)
試驗(yàn)分組:抗體原液孵育組、抗體+磷酸化抗原多肽預(yù)孵育組、抗體+同序列非磷酸化多肽預(yù)孵育組。
合格數(shù)據(jù)表現(xiàn):磷酸化多肽預(yù)孵育組可有效阻斷抗體結(jié)合,目的條帶信號(hào)明顯減弱;非磷酸化多肽預(yù)孵育組條帶信號(hào)與抗體原液組無(wú)顯著差異,證實(shí)抗體優(yōu)先識(shí)別磷酸化修飾的抗原表位。
3. 免疫熒光(ICC/IF)驗(yàn)證
通過(guò)藥物調(diào)控、磷酸酶處理方式干預(yù)細(xì)胞磷酸化水平,觀(guān)察熒光信號(hào)變化。藥物激活處理后,細(xì)胞內(nèi)靶蛋白磷酸化熒光信號(hào)上調(diào);藥物抑制或磷酸酶處理后,熒光信號(hào)出現(xiàn)明顯回落。樣本熒光定位與靶蛋白已知亞細(xì)胞分布特征一致,無(wú)大范圍彌散性非特異熒光信號(hào),抗體染色特異性良好。
4. IP-WB免疫沉淀驗(yàn)證
使用該磷酸化抗體進(jìn)行樣本免疫沉淀,再采用總靶蛋白抗體進(jìn)行WB檢測(cè)。試驗(yàn)結(jié)果顯示,正常裂解液樣本可富集得到目的靶蛋白;經(jīng)磷酸酶預(yù)處理的裂解液,抗體富集靶蛋白的能力明顯下降,說(shuō)明抗體可特異性識(shí)別并結(jié)合磷酸化修飾的靶蛋白,適用于磷酸化蛋白富集及相關(guān)互作實(shí)驗(yàn)。
5. IHC組織樣本驗(yàn)證
選用已知靶蛋白磷酸化高低表達(dá)的配對(duì)組織進(jìn)行染色驗(yàn)證。陽(yáng)性表達(dá)組織可在特異性功能區(qū)域出現(xiàn)陽(yáng)性染色信號(hào),陰性對(duì)照組織無(wú)明顯特異性染色;組織切片經(jīng)磷酸酶預(yù)處理后,原有陽(yáng)性染色信號(hào)顯著降低,符合磷酸化抗體的染色特征。
三、綜合驗(yàn)證結(jié)論
經(jīng)磷酸酶消化、位點(diǎn)突變、多肽封閉、藥物調(diào)控等多維度對(duì)照驗(yàn)證,該抗體的抗原結(jié)合活性依賴(lài)靶蛋白目標(biāo)位點(diǎn)的磷酸化修飾,對(duì)非磷酸化狀態(tài)的靶蛋白無(wú)明顯特異結(jié)合,非特異背景信號(hào)較低。驗(yàn)證結(jié)果表明該抗體可適配WB、IHC、ICC/IF、IP等常規(guī)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。受細(xì)胞生理狀態(tài)、內(nèi)源激酶活性、樣本處理?xiàng)l件影響,不同樣本的磷酸化本底信號(hào)會(huì)存在正常生理波動(dòng)。
四、異常數(shù)據(jù)判定說(shuō)明
1. 磷酸酶處理后磷酸化條帶信號(hào)無(wú)明顯變化,提示抗體存在不依賴(lài)磷酸化修飾的非特異結(jié)合。
2. 磷酸化多肽與非磷酸化多肽均可阻斷抗體信號(hào),說(shuō)明抗體表位識(shí)別特異性較差。
3. 位點(diǎn)突變樣本仍存在明顯磷酸化特異條帶,提示抗體存在異位點(diǎn)交叉識(shí)別的情況。
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